Trama
Gli Athosiani che vivono sulla terra ferma sono costretti a essere evacuati a causa di un enorme uragano che si sta per abbattere sul pianeta. Tutto il personale viene mandato su un altro pianeta, tranne McKay, Elizabeth e Sheppard che rimangono in città per mettere in atto un piano che dia potenza agli scudi. Purtroppo, grazie a delle spie, un gruppo armato di Genii arriva ad Atlantide e s'impadronisce della città.